Är NAD+ en peptid? Vad molekylen är och hur den hanteras
· Uppdaterad
NAD+ finns bland peptiderna men är inte en av dem. Så är molekylen byggd, och så skiljer sig hantering och analys.
I korthet
- g/mol, molmassan för NAD+
- 663,43
- aminosyror i molekylen
- Inga
- där NADH absorberar, men inte NAD+
- 340 nm
Kort sagt
NAD+ är ett koenzym av två nukleotider, inte en peptid, men det analyseras med samma metoder: HPLC för renhet och masspektrometri för identitet.
Är NAD+ en peptid?
Nej, NAD+ är ingen peptid. Molekylen innehåller inga aminosyror och inga peptidbindningar; den är ett koenzym byggt av två nukleotider, samma slags byggstenar som nukleinsyrorna består av.
Ämnet finns ändå i sortimentet, som NAD+, eftersom det hör hemma i samma forskningsfält som flera av peptiderna: cellernas energiomsättning och mitokondrierna. MOTS-c är ett exempel från samma fält, en peptid på 16 aminosyror som kodas i mitokondriernas eget DNA. Hur den förhåller sig till en annan mitokondriepeptid står i jämförelsen MOTS-c mot SS-31. Den här texten förklarar vad NAD+ är kemiskt och vad det betyder i labbet.
Vad består NAD+ av, och vad är NMN?
NAD+ består av två nukleotider, NMN och AMP, som är sammanbundna via sina fosfatgrupper. NMN, nikotinamidmononukleotid, bär basen nikotinamid och AMP bär adenin, och båda innehåller sockret ribos. Namnet nikotinamidadenindinukleotid räknar helt enkelt upp delarna, och NMN på egen hand är en mindre molekyl, inte NAD+.
Summaformeln är C21H27N7O14P2 och molmassan 663,43 gram per mol. Plustecknet i namnet syftar på den positiva laddningen på kvävet i nikotinamidringen, inte på hela molekylens laddning. Vid neutralt pH bär fosfatgrupperna negativa laddningar, så molekylen som helhet är inte positiv. Förkortningen finns också i ordlistan, tillsammans med de andra förkortningarna i våra texter.
Håll pulvret torrt
NAD+ drar åt sig fukt ur luften. Låt flaskan vara förseglad tills materialet ska användas i labbet, och följ den förvaring som anges på produktsidan och i dokumentationen.
Vad är skillnaden mellan NAD+ och NADH?
NAD+ och NADH är samma molekyl i två tillstånd: NAD+ är den oxiderade formen och NADH den reducerade. När NAD+ tar emot två elektroner och en proton, i form av en hydridjon, blir den NADH.
Paret fungerar som en bärare av elektroner i cellens ämnesomsättning, och det är därför molekylen dyker upp i så många forskningsområden. Skillnaden går att mäta: NADH absorberar ljus vid 340 nanometer, vilket NAD+ inte gör, och laboratorier följer därför många enzymreaktioner genom att mäta just den våglängden. Båda formerna absorberar vid 260 nanometer, där adeninet tar upp ljus.
NAD+ jämfört med en peptid
- Byggstenar Två nukleotider i stället för en kedja av aminosyror.
- Bindningar Fosfatgrupper binder ihop delarna, inga peptidbindningar.
- Mängd i flaskan 500 mg, ungefär 754 mikromol räknat på den fria formen.
- UV-mätning Kring 260 nanometer för adeninet, i stället för peptidbindningens 214.
Vad betyder 500 mg i en flaska NAD+?
500 mg är massan NAD+ i flaskan, och eftersom molekylen är liten motsvarar det många fler molekyler än i en typisk peptidflaska. Räknat på molmassan 663,43 gram per mol är det ungefär 754 mikromol.
Som jämförelse innehåller 10 mg MOTS-c, med molmassan 2174,6, ungefär 4,6 mikromol. Flaskan med NAD+ rymmer alltså ungefär 160 gånger fler molekyler. Räkningen gäller den fria formen: levereras ämnet som ett salt, till exempel med natrium, är molmassan högre och antalet mol något lägre. Hur milligram, mikrogram och andra enheter förhåller sig till varandra står i artikeln om enheter. Samma räkning för peptider, med saltformen inräknad, visar artikeln om molmassa och dalton.
Hur skiljer sig hanteringen från en peptid?
Hanteringen skiljer sig mest i att NAD+ är hygroskopisk: pulvret drar åt sig fukt ur luften. Leverantörer av laboratoriekemikalier anger därför att det torra ämnet ska förvaras torrt, svalt och mörkt i en tät förpackning.
NAD+ löser sig lätt i vatten, men i lösning är molekylen känslig för både sura och basiska förhållanden. Frågan om lösningsmedel är densamma som för peptiderna, och skillnaden mellan två vanliga sorter står i artikeln om bakteriostatiskt och sterilt vatten. Lösningsmedlet i sortimentet är bakteriostatiskt vatten. Vad som gäller för en viss flaska står på produktsidan och i dess dokumentation.
NAD+ finns bland peptiderna men är inte en av dem. Så är molekylen byggd, och så skiljer sig hantering och analys.
Hur analyseras en molekyl som inte är en peptid?
En molekyl som inte är en peptid analyseras med samma två metoder som en peptid: vätskekromatografi för renheten och masspektrometri för identiteten. Det som skiljer är detaljerna i hur signalen mäts.
Peptider mäts ofta med UV-ljus kring 214 nanometer, där peptidbindningen absorberar. NAD+ saknar peptidbindningar men har adenin, som absorberar vid 260 nanometer, så det är den våglängden som ligger nära till hands. Masspektrometrin ska visa en massa som stämmer med molekylen, i den jonform som mäts. Vad renhetssiffran betyder står i artikeln om renhet, och certifikaten per batch finns i certifikatbiblioteket.
Samma analys, en annan molekyl
Renhet och identitet redovisas per batch i analyscertifikatet.